Действие кликера основано на простейшем условном рефлексе: щелчок - лакомство. Животное приучают к тому, что каждый раз после щелчка оно получит лакомство. Очень скоро животное начинает узнавать щелчок кликера и тогда им можно уже пользоваться как подкреплением.
Плюс кликера - он позволяет дать моментальное поощрение именно в тот момент времени, когда животное делает что-то правильно, то есть подкрепить поведение.